MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 4272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009468	TCA	2	6	177001	177006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243969
4002	NC_009468	CAT	2	6	177024	177029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243969
4003	NC_009468	TATTC	2	10	177103	177112	20 %	60 %	0 %	20 %	148243969
4004	NC_009468	GAA	2	6	177119	177124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243969
4005	NC_009468	A	6	6	177139	177144	100 %	0 %	0 %	0 %	148243969
4006	NC_009468	CGG	2	6	177152	177157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4007	NC_009468	TGG	2	6	177179	177184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243969
4008	NC_009468	GCA	2	6	177189	177194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4009	NC_009468	GAG	2	6	177217	177222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243969
4010	NC_009468	TCG	2	6	177299	177304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4011	NC_009468	GCG	2	6	177308	177313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4012	NC_009468	GTC	2	6	177314	177319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4013	NC_009468	CGGC	2	8	177326	177333	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4014	NC_009468	ATC	2	6	177335	177340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243969
4015	NC_009468	GC	3	6	177341	177346	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4016	NC_009468	CGC	2	6	177359	177364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4017	NC_009468	TCG	2	6	177368	177373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4018	NC_009468	TCCAG	2	10	177378	177387	20 %	20 %	20 %	40 %	148243969
4019	NC_009468	GCC	2	6	177455	177460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4020	NC_009468	CCG	2	6	177504	177509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4021	NC_009468	ATG	2	6	177533	177538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243969
4022	NC_009468	GGTGA	2	10	177583	177592	20 %	20 %	60 %	0 %	148243969
4023	NC_009468	TCT	2	6	177609	177614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243969
4024	NC_009468	TCA	2	6	177633	177638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243969
4025	NC_009468	GGC	2	6	177670	177675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4026	NC_009468	AGG	2	6	177686	177691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243969
4027	NC_009468	GGT	2	6	177696	177701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243969
4028	NC_009468	GC	3	6	177743	177748	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4029	NC_009468	GCC	2	6	177754	177759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4030	NC_009468	CAT	2	6	177760	177765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243969
4031	NC_009468	CGC	2	6	177766	177771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4032	NC_009468	GCG	2	6	177800	177805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4033	NC_009468	GC	3	6	177837	177842	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4034	NC_009468	GAT	2	6	177847	177852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243969
4035	NC_009468	CAG	2	6	177853	177858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4036	NC_009468	CGC	2	6	177870	177875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4037	NC_009468	CCG	2	6	177944	177949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4038	NC_009468	GC	3	6	177970	177975	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4039	NC_009468	GCC	2	6	178001	178006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4040	NC_009468	CGC	2	6	178017	178022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4041	NC_009468	CGA	3	9	178029	178037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4042	NC_009468	GCC	2	6	178039	178044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4043	NC_009468	CCA	2	6	178054	178059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243969
4044	NC_009468	CGG	2	6	178095	178100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4045	NC_009468	GAGCC	2	10	178127	178136	20 %	0 %	40 %	40 %	148243969
4046	NC_009468	CGG	2	6	178137	178142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4047	NC_009468	AGGCCG	2	12	178145	178156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243969
4048	NC_009468	AGCC	2	8	178157	178164	25 %	0 %	25 %	50 %	148243969
4049	NC_009468	CGA	2	6	178182	178187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
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4051	NC_009468	GCG	2	6	178212	178217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4052	NC_009468	GGC	2	6	178233	178238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4053	NC_009468	GGA	2	6	178239	178244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243969
4054	NC_009468	CGG	2	6	178248	178253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4055	NC_009468	ATG	2	6	178277	178282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243969
4056	NC_009468	CAG	2	6	178303	178308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4057	NC_009468	AGG	2	6	178325	178330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243969
4058	NC_009468	GCG	2	6	178331	178336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4059	NC_009468	CCG	2	6	178353	178358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4060	NC_009468	CGA	2	6	178380	178385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4061	NC_009468	GGC	3	9	178438	178446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4062	NC_009468	GCC	2	6	178447	178452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4063	NC_009468	ATG	2	6	178457	178462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243969
4064	NC_009468	GCC	2	6	178486	178491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4065	NC_009468	GAG	2	6	178511	178516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243969
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4068	NC_009468	GC	3	6	178621	178626	0 %	0 %	50 %	50 %	148243969
4069	NC_009468	GCC	2	6	178648	178653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4070	NC_009468	GCC	2	6	178687	178692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243969
4071	NC_009468	CGGCG	2	10	178693	178702	0 %	0 %	60 %	40 %	148243969
4072	NC_009468	GCA	2	6	178773	178778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243969
4073	NC_009468	CGGT	2	8	178847	178854	0 %	25 %	50 %	25 %	148243969
4074	NC_009468	GCG	2	6	178876	178881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243969
4075	NC_009468	AT	3	6	178959	178964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_009468	ATGC	2	8	178993	179000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_009468	ATG	2	6	179016	179021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_009468	CCG	2	6	179085	179090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_009468	C	6	6	179109	179114	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4080	NC_009468	CTC	2	6	179129	179134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_009468	GTA	2	6	179142	179147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009468	GCA	2	6	179200	179205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_009468	TGG	2	6	179223	179228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_009468	CTT	2	6	179291	179296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_009468	GCT	2	6	179320	179325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009468	ACG	2	6	179380	179385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009468	TTC	2	6	179572	179577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_009468	T	7	7	179600	179606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_009468	ATA	2	6	179617	179622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_009468	TTG	2	6	179721	179726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_009468	GCA	2	6	179949	179954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_009468	CGA	3	9	180033	180041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_009468	GCGG	2	8	180067	180074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_009468	GCG	2	6	180119	180124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_009468	GCG	2	6	180137	180142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_009468	TGT	2	6	180290	180295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243970
4097	NC_009468	CGG	2	6	180311	180316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243970
4098	NC_009468	GTG	2	6	180358	180363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243970
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4100	NC_009468	CTG	2	6	180393	180398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243970
4101	NC_009468	AGGA	2	8	180493	180500	50 %	0 %	50 %	0 %	148243970
4102	NC_009468	GGC	2	6	180570	180575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243970
4103	NC_009468	CCT	2	6	180617	180622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243970
4104	NC_009468	GATC	2	8	180638	180645	25 %	25 %	25 %	25 %	148243970
4105	NC_009468	CTT	2	6	180714	180719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243970
4106	NC_009468	GAT	2	6	180741	180746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243970
4107	NC_009468	TCC	2	6	180757	180762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243970
4108	NC_009468	GCC	2	6	180811	180816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243970
4109	NC_009468	ACG	2	6	180913	180918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243970
4110	NC_009468	CG	4	8	180944	180951	0 %	0 %	50 %	50 %	148243970
4111	NC_009468	TCAA	2	8	181040	181047	50 %	25 %	0 %	25 %	148243970
4112	NC_009468	GGTT	2	8	181060	181067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_009468	CGG	2	6	181094	181099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243971
4114	NC_009468	AAG	2	6	181157	181162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243971
4115	NC_009468	CCA	2	6	181168	181173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243971
4116	NC_009468	ACC	2	6	181302	181307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243971
4117	NC_009468	CAG	2	6	181328	181333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243971
4118	NC_009468	CGC	2	6	181413	181418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243971
4119	NC_009468	CAT	2	6	181463	181468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243971
4120	NC_009468	CCCA	2	8	181469	181476	25 %	0 %	0 %	75 %	148243971
4121	NC_009468	GCC	2	6	181478	181483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243971
4122	NC_009468	CAT	2	6	181484	181489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243971
4123	NC_009468	CGC	2	6	181492	181497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243971
4124	NC_009468	CCG	2	6	181531	181536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243971
4125	NC_009468	AGA	2	6	181572	181577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243971
4126	NC_009468	GC	3	6	181588	181593	0 %	0 %	50 %	50 %	148243971
4127	NC_009468	CTG	2	6	181629	181634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243971
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4129	NC_009468	CCG	2	6	181691	181696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_009468	ATCTCG	2	12	181720	181731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243972
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4144	NC_009468	GAGCGT	2	12	182317	182328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243972
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4147	NC_009468	GCA	2	6	182486	182491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243972
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4198	NC_009468	TGG	2	6	184821	184826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4202	NC_009468	TCG	3	9	184916	184924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_009468	GGT	2	6	186337	186342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243976
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4250	NC_009468	CGA	3	9	186477	186485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243976
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4255	NC_009468	GCC	2	6	186752	186757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243976
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4257	NC_009468	AGC	2	6	186785	186790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243976
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4261	NC_009468	GCT	2	6	186951	186956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243976
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4263	NC_009468	CCG	2	6	186981	186986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243976
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4265	NC_009468	TCG	2	6	187085	187090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243976
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4268	NC_009468	CCG	2	6	187187	187192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4269	NC_009468	C	9	9	187236	187244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4270	NC_009468	GTTC	2	8	187258	187265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4271	NC_009468	TGA	2	6	187325	187330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_009468	TGTCA	2	10	187338	187347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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